经过近年来的发展，我国物流税收改革取得了阶段性成果，有力地改善了物流业发展的政策环境。但是，就现阶段而言，我国在税收管理方面仍面临着许多问题。
　　国家为了减轻企业和社会负担、促进经济稳定增长，自2013年1月1日起，取消和免征了30项行政事业性收费。然而，这一利好政策却并未能得到全面的落实。一些地方依旧我行我素，存在着严重的照常收费、变相收费等现象，甚至所收税费远远超过了之前的标准，而涉企收费项目繁多，反而加重了物流企业的税费负担。
　　事实上，在行政事业性收费问题上，我国一直存在着审批项目过多、审批手续复杂、审批效率低下等诸多问题。特别是由于税收管理和程序的不规范、不透明，使得许多地方性税收方面都存在着"灰色地带"。这些问题不仅给物流企业带来了手续上的麻烦，还增加了物流成本与运营负担。
　　笔者认为，造成这一问题的因素主要有两个方面：
　　一方面，由于地方政府与相关部门受到了利益的驱使，对政策措施肢解、曲解，没有将行政事业费的取消落在实处；另一方面，在少数地方权力运行中，扭曲了公共政策的本意，再加上一些地方的干部政绩考核导向不够明确，以及政策法规执行监控不力，便在改革措施执行上唱起了"对台戏"。
　　从属性上看，物流的各种服务分属于不同的类别，具有不同的税制特点，而行政事业性收费问题恰恰暴露出了现行税收管理体制的不适应性。为此，如何建立符合我国物流业发展的税收管理体系，发挥税收管理的经济调节功能，便显得十分重要。
　　根据我国物流税收制度的特征来看，笔者认为，要想推进行政事业性收费的取消早日落在实处，就要建立统一、公开、透明的税收管理机制。
　　首先，要建立统一开放、公平竞争、规范有序的现代物流税收制度。通过废除各类不符合国家法律、法规规定的由部门或地方制定的地区封锁、行业垄断、市场分割的有关规定，可以为物流企业的经营和发展创造宽松的外部环境。
　　其次，要加强收费管理能力，全面清理向货运车辆收取的行政事业性收费、政府性集资、政府性基金、罚款项目，取消不符合国家规定的各种收费项目。同时，还要全面整顿道路收费站点，对违反国家规定设置的收费站点，应立即停止收费，并限期拆除相应设施，严禁向物流企业乱检查、乱收费、乱摊派、乱罚款、乱评比。
　　再次，要加强各部门之间的组织协调能力，在税收管理方面应互相监督，认真履行税收职责。同时，还要树立起适应科学发展要求的正确政绩观，通过建立干部政绩的科学考核机制，完善政策法规执行监控系统，可以有效地增强政策执行监控机构的权威性、独立性，从而加强税收制度的规范性。